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宏基因組測序

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環境微生物研究,一站式解決

宏基因組學(Metagenomics),又稱元基因組學,
是以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象,無需分離培養,直接提取環境樣本DNA進行測序,
研究環境微生物的群落結構、物種分類、系統進化、基因功能及代謝網絡等,已廣泛應用于微生物領域。

周期短,通量高,信息全。

諾禾致源宏基因組研究采用先進的Illumina測序平臺,結合樣品特點
和數據的產出,選取最優組裝效果,充分挖掘環境樣品中的微生物菌群和功能基因。
具有“周期短、通量高、信息全”的優勢,已廣泛應用于土壤、海洋等研究中。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象,直接提取環境樣本
DNA,采用新一代測序技術,獲得環境微生物基因信息總和。

分析內容 解決問題
測序數據質量評估 過濾掉低質量數據,保證數據質量
基因預測 基因預測及相關性分析
物種、功能注釋 物種、基因功能注釋及相關分析
CARD 耐藥基因相關分析
CAG/MLG分析 疾病和菌株關聯研究
CNV(copy number variation) 菌株拷貝數變異與疾病關聯研究
噬菌體 噬菌體及前噬菌體預測及分析

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

宏基因組測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

項目經驗豐富

至2019年8月,諾禾致源宏基因組樣本數突破50000例,
包括土壤、水體、糞便、淤泥等樣本。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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