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MeRIP-seq

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MeRIP-seq 全面高效分析 mRNA 的 m6A 修飾情況

RNA甲基化免疫共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation,MeRIP)基于 m6A 特異性抗體識別并結合 mRNA 上 m6A 的原理,以 RNA 免疫共沉淀方法富集甲基化修飾片段為基礎,并聯合高通量測序,研究發生 m6A 甲基化修飾的 mRNA 區域。

全面、高效、性價比高

RNA 修飾能夠在轉錄后水平上調控 RNA 的穩定性、定位、運輸、剪切和翻譯,因此 MeRIP 有助于在癌癥發生和轉移、胚胎發育、脂類代謝、環狀 RNA 翻譯和 DNA 損傷修復等生物學功能和作用機制方面的研究。具有“全面、高效、性價比高”的優勢,已廣泛應用于人、大鼠、小鼠、豬、擬南芥等物種的研究。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

諾禾致源 MeRIP 測序項目對
IP 實驗合格的 RNA 樣本建庫
測序,獲得高質量 reads,通
過 motif 分析判斷 IP 的特異
性以及分析的可信性,高效預
測相關基因,進行功能富集分
析,構建m6A修飾圖譜。

MeRIP-seq 分析內容 解決問題
標準分析 測序數據質量評估 過濾掉低質量數據,保證數據質量
參考序列比對分析 唯一比對的 reads 分布統計
Peak calling 檢出發生 m6A 修飾的可信區域
Motif 分析 蛋白結合序列的偏好性
Peak 峰相關基因注釋 Peak 在基因組及轉錄本
功能區上的分布
差異 peak 分析 分析不同樣本間差異 peak 峰
相關基因功能分析 Peak 相關基因 GO,
KEGG 富集分析
個性化分析、多組學關聯分析需聯系產品經理進行評估。

悅讀高質量測序數據,盡享 HPC 澎湃動力

MeRIP 測序采用先進的 Illumina 測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用 DELL 計算節點和 Isilon 存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

諾禾致源已經成功完成對人、豬,擬南芥等物種進行 MeRIP 測序分析,助力客戶在 Hepatology 等權威雜志發表多篇高水平文章。“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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